Potranno non piacere, è vero. Ma si tratta di un gusto personale. Se però si considerano quelle, per così dire “classiche”, mi riferisco a :-), ;-), :-(, insomma quelle che più riportano ad una nostra spontanea reazione quando riceviamo un messaggio, sia esso mediato o meno, allora vanno semplicemente considerate un mezzo per trasmettere un nostro feedback che altrimenti passerebbe inosservato.
Faccio un esempio. Tizio chiede a Caio com’è andata la sua giornata, Caio risponderà:
– Bene! (apparendo abbastanza neutro, magari senza nemmeno troppa voglia di parlare);
– Bene! 
(facendo trapelare che è andata davvero bene la sua giornata);
– Bene! 
(qui il bene è nettamente ironico, da leggere come “una giornata da dimenticare).
Insomma, se piacciono o meno è indifferente, ma non si può negare che influiscano.